We zitten (vaak) met grote brokken DNA in onze mond

Inocels, brokken extrachromosomaal DNA

Schema van, mogelijke functies en relaties van die inocels in onze mond e.o. (afb: Kiguchi et al.)

Driekwart van alle mensen herbergt mogelijk net ontdekt genetisch materiaal in hun mond, zogeheten extrachromosoom-elementen, die de Japanse ontdekkers inocels hebben gedoopt. Die inocels zouden invloed kunnen hebben op de mondgezondheid, afweer en een rol kunnen spelen bij het ontstaan van ziektes, speculeren de onderzoekers. Ze zouden bacteriën helpen zich aan te passen aan het menselijk organisme. Lees verder

Ki maakt ook de blitz bij Nobelprijs scheikunde

RoseTTAFold

Niet alleen de structuur van de eiwitten is belangrijk maar ook de wisselwerking met andere biomoleculen (afb: github.com/baker-laboratory)

De Nobelprijs voor natuurkunde werd dit jaar toegekend aan twee pioniers op het gebied van kunstmatige intelligentie. Die voor scheikunde gaat naar de grondleggers van ki-systemen die de vorm van eiwitten voorspellen, een belangrijk gegeven voor de werking van de ‘werkpaarden’ van het leven. John Jumper en Demis Hassabis van Google Deepmind (AlphaFold) delen de helft van de prijs, de andere helft gaat naar de Amerikaan David Baker van de universiteit van (de staat) Washington in Seattle. Lees verder

Eiwitstructuurvoorspeller AlphaFold kan dat nu ook met niet-eiwitten

eiwitstructuur

De structuur van eiwitten zegt veel over zijn functionaliteit

De vorm van een eiwit zegt veel over waar dat voor dient. Tot niet zo heel lang geleden moest die vorm vaak met veel moeite worden achterhaald, tot Google in 2019 met AlphaFold op de proppen kwam. Dat schijnt het eiwitonder-zoek, in combi-natie met kunst-matige intelligentie, een heel eind op weg gebracht te hebben. Nu kan AlphaFold ook de structuur (en daarmee wisselwerking met andere verbindingen) voorspellen van andere biomoleculen dan eiwitten. Lees verder