Categorie archieven: onderzoek

Spellen en weblabs in de strijd tegen fraude en fouten

Geplaatst op door
Beantwoorden
EteRNA: spelen met RNA

Spelen met RNA, de gang van het ontwerpproces in EteRNA (afb: PNAS)

Volgens Adrien Treuille van de Carnegie Mellon-universiteit en Rhiju Das van de Stanford-universiteit (beide in de VS), kunnen massale  ‘weblabs’ met behulp van video-spellen fouten en fraude in de bioweten-schappen of zelfs de hele wetenschap zo veel mogelijk uitbannen. Aan die weblabs zouden dan vele niet-professionele onderzoekers kunnen deelnemen. Volgens het tweetal is die spelachtige benadering wetenschappelijk deugdelijker dat de gebruikelijke praktijk in de wetenschappen waarbij er eerst een mogelijke verklaring voor een verschijnsel wordt geopperd, waarna wetenschapper die hypothese proefondervindelijk probeert te bewijzen. Ze publiceerden hun bevindingen op de webpagina’s van het blad Trends in Biochemical Sciences (waar ik het niet kan vinden). Eerder dit jaar schreven ze een soortgelijk artikel over hun RNA-massaproject EteRNA. Lees verder →

Vraagtekens bij deugdelijkheid klinische proeven

Geplaatst op door
Beantwoorden
Shanil Ebrahim

Shanil Ebrahim (Stanford-universiteit)

De deugdelijkheid van medicijnen en behandelingswijzen moet in klinische proeven worden aangetoond. Die kunnen worden gewogen door evalueringen of heranalyses. Dat gebeurt erg weinig, maar die weinige die er zijn wijken nogal eens af van de oorspronkelijke studie, zo concludeerden onderzoekers van de Amerikaanse Stanford-universiteit, op basis van de analyses van onderzoekgegevens van evaluaties van klinische proeven. Ze wilden bekijken of een heranalyse van de oorspronkelijke gegevens van klinisch onderzoek effect had op het resultaat of de behandelingsaanbevelingen. Dat zou in 35% van de gevallen (het ging om 37 ‘heranalyses’) inderdaad het geval zijn. Opmerkelijk is dat die heranalyses maar in een klein aantal gevallen (5 van de 37) door onafhankelijke onderzoekers zijn gedaan. Lees verder →

Watson leest even 70 000 artikelen

Geplaatst op door
Beantwoorden
Scott Spangler, IBM

IBM-onderzoeker Scott Spangler laat zien dat Watson verbanden in kennis kan vinden (foto: IBM)

Mensen griezelen al eeuwen over het moment dat de machines en robots de macht overnemen. Op een paar ondergeschoven terreinen is dat al gebeurd. Machines kunnen al een tijdje beter schaken dan de beste menselijke schaker, moest grootmeester Genni Kasparov tot zijn eigen schande in 1997 toegeven. IBM heeft nu supercomputer Watson. Drie jaar geleden versloeg Watson mensen-van-vlees-en-bloed in het vraag-en-antwoordspelletje Jeopardy. Nu stelt IBM Watson, tegen betaling, beschikbaar als ‘ontdekkingsreiziger’  op het gebied van moleculaire biologie voor bedrijven en onderzoekorganisaties. Voorlopig is Watson nog vrij beperkt. Lees verder →

Doorzichtige muis

Geplaatst op door
Beantwoorden
Doorizchtige labmuis

Twee tot drie dagen na het inspuiten van een speciaal gel werden delen van de muis doorzichtig. Na 14 dagen was dat proces voltooid (C. hersens, B. nieren (pijl), hart, longen en darmen van de buik gezien, A. rugzicht). (foto: © Yang et al, Cell)

Het heeft iets van diermishandeling. Onderzoekers van het Amerikaanse onderzoeksinstituut CalTech hebben doorzichtige muizen ‘geproduceerd’. Eerder was dat gelukt bij embryo’s of bij hersens, maar nog nooit bij volwassen dieren, zo vertellen de onderzoekers trots. Het dier als ding, volslagen ondergeschikt aan de grillen en de wensen van de mens. Bij een doorzichtige muis hoef je niet allerlei trucs uit te halen om inwendige processen te kunnen volgen, is de overweging van de Amerikaanse geleerden geweest. Lees verder →

Hersenonderzoekers dreigen met boycot duur EU-project

Geplaatst op door
Beantwoorden
Human Brain Project

Het grootscheepse Europese hersenproject zou te veel op de supercomputer gericht zijn, vinden kritische hersenonderzoekers

Het Human Brain Project, het ambitieuze EU-onderzoeksproject begroot op € 1,2 miljard dat gericht is op het nabootsen van hersens op supercomputer, ligt zwaar onder vuur van de hersenonderzoekers. Het project, waar zo’n 500 onderzoekers in 20 landen aan meewerken, zou volgens de kritische onderzoekers gebukt gaan onder bureaucratie en geleuter. Het project zou inzicht moeten geven in het ontstaan van hersenziektes, maar ook in de werking van hersenprocessen. Zo’n 300 onderzoekers tekenden een open brief aan de Europese commissie over de in hun ogen falende projectleiding. Lees verder →

Replicatie onderzoek kan leiden tot ‘stammenstrijd’

Geplaatst op door
Beantwoorden
Psychologisch onderzoek

Bij de herhaling van psychologisch onderzoek is nauwkeurige replicatie vaak lastig.

Natuurwetenschappers kijken nogal eens met enig dédain naar de verrichtingen van hun alfa- en gamma-collega’s: geen wetenschap want moeilijk kwantificeerbaar, dus vooral een botsing van meningen, iets in die ordegrootte. Die houding lijkt gerechtvaardigd te worden door replicatie van een aantal aloude onderzoeken in de psychologie, waarbij de nieuwe uitkomsten nogal eens afwijken van de oude. Lees verder →

Hoe betrouwbaar is de uitkomst van medisch onderzoek?

Geplaatst op door
Beantwoorden

Betrouwbaar medisch onderzoekVooral medisch onderzoek kan verwachtingen bij mensen wekken die, achteraf gezien, niet waargemaakt kunnen worden of zelfs helemaal onterecht waren, omdat het niet deugde. Dan heb ik het niet eens over fraude. Het komt nogal eens voor dat de onderzoekers door de bomen het bos niet zien of dat ze verkeerde conclusies trekken omdat ze statistisch maar matig onderlegd zijn. Als ik zes keer zes gooi met een dobbelsteen, hoe groot is dat kans dat ik de zevende keer weer zes gooi? Volgens een artikel van de BBC stijgt het aantal teruggetrokken medische artikelen in wetenschappelijke bladen sterk: van 30 in 2000 naar 400 in 2010, terwijl het aantal geschreven artikelen in die periode maar met 44% steeg. De cijfers zouden van het wetenschapsblad Nature komen. Lees verder →

Proeven met muizen zeggen lang niet alles

Geplaatst op door
Beantwoorden
Dierproeven vaak 'misbruikt'

Het ALS-instituut vond grote verschillen tussen de gepubliceerde onderzoeksgegevens (blauw) en de eigen gereproduceerde gegevens (zwart) (afb: Nature)

Hebben we net (weer eens) het schandaal aan de orde gesteld dat farma-ceutische bedrijven de boel vaak belazeren, komt het Franse dagblad Le Monde op zijn webstek met het verhaal dat er veel geld wordt weggesmeten aan klinische proeven van (gedachte) medicijnen of behandelmethoden die bij muizen werken, maar bij mensen niks uit halen. Le Monde spreekt over de honderden miljoenen die er gemoeid zijn met dit ‘schandaal’, die er verspild worden met de klinische proeven met deze voor de mens nuttelozen geneesmiddelen of -wijzen. Le Monde schrijft het  naar aanleiding van een artikel in het wetenschapsblad Nature van Steve Perrin, verbonden aan het ALS-instituut in het Amerikaanse Cambridge (ALS is een verwoestende spierziekte) . Perrin constateert dat veel van die dierproeven methodologisch niet deugen.
Lees verder →